自然観察・自然史
- 上越市立水族博物館うみがたり（外部リンク） ：2018年にグランドオープン。飼育数世界一を誇るマゼランペンギンの群れやイルカたちの華麗なパフォーマンスをご覧ください。
- 国立公園（外部リンク）：サイト内に、「妙高戸隠連山国立公園」の紹介があります。
- 妙高高原ビジターセンター（外部リンク）
- 十日町市立里山科学館 越後松之山「森の学校」キョロロ（外部リンク）
- 糸魚川市ホームページ（外部リンク）：サイト内に、「フォッサマグナミュージアム」の紹介があります。
- 糸魚川ジオパーク（外部リンク）
- 石川県ホームページ（外部リンク）：サイト内に、「白山自然保護センター」の案内が掲載されています。
- 石川県立自然史資料館（外部リンク）：石川県立自然史資料館ニュースレター「自然史かわらばん」を読むことができます。朱鷺（トキ）の骨格標本写真が掲載されているなど、読んで学べる資料が公開されています。
昆虫
- 新潟県胎内市ホームページ（外部リンク）：サイト内に、「胎内昆虫の家」の紹介があります。
- 長野県辰野町ホームページ（外部リンク）：サイト内に、「世界昆虫館」の紹介があります。
- 群馬県立ぐんま昆虫の森（外部リンク）
- 石川県ふれあい昆虫館（外部リンク）：石川県立施設です。昆虫の飼育方法が掲載されています。
- 静岡県磐田市竜洋昆虫自然観察公園（外部リンク）
- 奈良県橿原市ホームページ（外部リンク）：「橿原市昆虫館」の昆虫館だより「Darwin」に、昆虫に関する面白い話が掲載されています。
- 大阪府箕面市ホームページ（外部リンク）：箕面市には「箕面公園昆虫館」があり、市のホームページ内にはデジタル昆虫図鑑があります。
地質・古生物
- 地質標本館（外部リンク）：国立研究開発法人産業技術総合研究所が運営する見学施設。
- 野尻湖ナウマンゾウ博物館（外部リンク）：旧石器時代、氷河時代の人類が使っていた旧石器、ナウマンゾウの化石、ナウマンゾウ復元像が展示されています。
- 長野市立博物館（外部リンク）
- 長野市立博物館分館 戸隠地質化石博物館（外部リンク）
- 長野市立博物館分館 信州新町化石博物館（外部リンク）
- 長野県松本市ホームページ（外部リンク）：「松本市立博物館」「四賀化石館」の案内が掲載されています。
- 群馬県吾妻郡長野原町 浅間火山博物館（外部リンク）：群馬県吾妻郡嬬恋村にある群馬県吾妻郡長野原町立の施設。
- 福井県立恐竜博物館（外部リンク）
科学技術全般
- 国立科学博物館（外部リンク）
- 日本科学未来館（外部リンク）：国立研究開発法人 科学技術振興機構（JST）が運営するサイトです。
- サイエンス・スクエアつくば（外部リンク）：国立研究開発法人 産業技術総合研究所が運営している見学施設です。
- サンエンス・スクエア臨海（外部リンク）：国立研究開発法人 産業技術総合研究所が運営している見学施設です。産業技術総合研究所臨海副都心センターにあります。
- 富山県富山市科学博物館（外部リンク） ：プラネタリウム併設
- 長野県佐久市子ども未来館（外部リンク）：プラネタリウム併設
天文・宇宙・気象
- 上越清里星のふるさと館（外部リンク）
- JAXA 宇宙航空研究開発機構（外部リンク）：サイト内に、「宇宙科学研究所」、キッズ「ファン!ファン!JAXA!」の紹介があります。
- 自然科学研究機構 国立天文台（外部リンク）：サイト内に、口径30m次世代超大型望遠鏡プロジェクトを推進する「TMT推進室」の紹介があります。
- 気象庁ホームページ（外部リンク）：気象、地震、津波、火山についての解説があります。
- 富山市科学博物館付属 富山市天文台（外部リンク）
- 長野市立博物館（外部リンク）：プラネタリウムもあります。
県内の情報
- ラ・ラ・ネット 新潟県生涯学習情報提供システム（外部リンク）：新潟県立生涯学習推進センターです。
- 新潟文化物語（外部リンク）：特定非営利活動法人新潟NPO協会が、新潟県文化振興課から委託を受けて運営しているサイトです。
- 新潟県立自然科学館（外部リンク）
- 新潟県立歴史博物館（外部リンク）
- 長岡市立科学博物館（外部リンク）
雪と氷
- 加賀市中谷宇吉郎雪の科学館（外部リンク）：加賀市立の施設のサイトです。中谷宇吉郎は、世界で初めて人工雪を作ることに成功した雪の研究者です。
- 白瀬南極探検隊記念館（外部リンク）：秋田県にかほ市立の施設です。
- 北海道旭川市ホームページ（外部リンク）：サイト内に「旭川市科学館 サイパル」のウェブページがあります。
- 名古屋市科学館（外部リンク）：マイナス30度の展示室で、オーロラの全天周映像を見ることができる「極寒ラボ」があります。
- 雪氷防災研究センター（外部リンク）：国立研究開発法人 防災科学技術研究所の雪氷防災研究センターです。降積雪観測データ、なだれの発生メカニズムの解説などがあります。
子ども向け
- やまびこネット（外部リンク）：公益財団法人日本博物館協会が制作した子ども向けサイト。
- 産総研・サイエンス・タウン（外部リンク）：国立研究開発法人 産業技術総合研究所した子ども向けサイト。
- 国立研究開発法人 海洋研究開発機構「ジャムステック」（外部リンク）：サイト内に子ども向けの「キッズ」サイトがあり、深海探査、深海生物などが紹介されています。
ポータルサイト
- 科学技術 すべて伝えます Science Portal（外部リンク）：国立研究開発法人 科学技術振興機構（JST）が運営するサイトです。「科学館・やさしい科学サイト」で科学を楽しく学ぶサイトが紹介されています。
- 公益社団法人日本植物園協会（外部リンク）：日本植物園協会に加盟している植物園が紹介されています。
- 公益社団法人日本動物園水族館協会（外部リンク）：日本動物園水族館協会に加盟している動物園水族館が紹介されています。
- サイエンスミュージアムネット（外部リンク）：国立科学博物館が運営しているサイトで、全国の科学系博物館が運営に協力しています。